雖然很多人對于膀胱功能檢查在IC的診斷價值存有爭論，但它對膀胱不穩定造成刺激性癥狀的分辨確有幫助。膀胱過動癥和IC在癥狀上有重疊的現象（即頻尿、尿急、尿急性失禁）。在一般膀胱功能檢查時，很多IC病人表現出感覺性急尿，極不穩定膀胱，膀胱容積下降，及膀胱在低容量時呈現疼痛現象。ICDB的資料顯示，頻尿的程度和最大膀胱容量及最初尿急現像呈現正比關系，但膀胱功能和一般生理狀況(（疼痛及整體健康情況）卻無相關性存在。有趣的是IC病患中有15％會出現膀胱不自主收縮現象（10）。 目前大家一致的看法是，膀胱功能檢查對于IC的診斷并非絕對必要，但卻能提供解尿疼痛癥狀群及膀胱過動癥的鑑別診斷，至于更詳細的尿路攝影性動力學檢查（Videourodynamic study），在診斷上則沒有太多的幫助。